PANGOLIN
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| File:Pangolin logo.svg PANGOLIN logo | |
| 首次发布 | 2020年4月30日 |
|---|---|
| 源代码库 | github |
| 编程语言 | Python |
| 许可协议 | GNU通用公共许可证 |
PANGOLIN（Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages，中文又翻译为彭高命名系统）是一个由Rambaut Lab成员开发的软件工具，与其相关的网络应用由位于英国南剑桥郡的基因组病原体监测中心开发[1]。该工具可以被用来对严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2的基因谱系进行动态命名（PANGO命名法）[2]。
据此命名系统的发起人之一Andrew Rambaut所说，SARS-CoV-2有数以万计的基因体，该基因体数量可是前所未见的，由于截至2020年7月还没有共识去为SARS-CoV-2种系命名，因此就订出这个Pango Lineage系统来为基因体谱系命名。
参考文献[编辑]
- ↑ Real-Time Epidemiology for COVID-19. www.pathogensurveillance.net. [22 January 2021]. （原始内容存档于2021-01-17）.
- ↑ Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á.; et al. A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology. Nature Microbiology. 2020, 5 (11): 1403–1407 [2021-05-15]. PMID 32669681. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. （原始内容存档于2020-12-24）.