Dicer

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Dicer蛋白在人体内由DICER1基因编码，是一种在RNA干扰中扮演着重要角色的RNA酶，属于III型RNA酶。在RNA诱导沉默复合体（RISC）的激活中，Dicer扮演着核心角色。在RNA干扰过程中，Dicer可以将shRNA（小发卡RNA）切割、加工为siRNA（小干扰RNA），将miRNA前体加工为miRNA（微RNA）。

功能[编辑]

File:MiRNA-biogenesis.jpg
Dicer酶的作用是将shRNA剪切为siRNA或将miRNA前体剪切为miRNA

Dicer酶会将转录而成的、经Drosha酶初步处理的shRNA（小发卡RNA）剪切为siRNA，或将miRNA前体（pre-miRNA）剪切为miRNA。随后，siRNA或miRNA会激活RISC的组装和功能的行使，使RNA干扰得以继续进行[1]。

结构[编辑]

File:2ffl-by-domain.png
肠贾第鞭毛虫（Giardia intestinalis）体内的Dicer蛋白。III型RNA酶结构域以绿色标出，PAZ以黄色标出，平台结构域以红色标出，连接不同结构域的螺旋以蓝色标出[2]

人DICER蛋白属于III型RNA酶，具有解旋酶活性以及PAZ结构域（Piwi（英语：Piwi）/Argonaute/Zwille）[3][4]。除了上述结构域外，DICER蛋白还有两个RNaseIII结构域和两个双链RNA结合结构域（DUF283和dsRBD）[5]。

目前的研究表明PAZ结构域可以和shRNA（小发卡RNA）3'端两个凸出的核苷酸结合，III型RNA酶结构域则会在dsRNA周围形成一个假二聚体，启动核酸链的剪切，使shRNA长度逐渐缩短。PAZ结构域和III型RNA酶结构域之间的距离由连接他们的螺旋结构决定，会影响到产生的miRNA/siRNA长度[2]。Dicer的dsRBD结构域会与shRNA结合，不过目前并未解析出具体的结合位点。推测认为dsRBD区可能会与一些调节蛋白（比如人体内的TRBP，果蝇体内的R2D2、Loqs）结合形成复合体，调控RNA酶活性，进而调节终产物的产生[6]。有推测认为解旋酶结构域会参与对长底物的处理[6]

参见[编辑]

参考[编辑]

  1. ^ Bernstein E, Caudy A, Hammond S, Hannon G. Role for a bidentate ribonuclease in the initiation step of RNA interference. Nature. 2001, 409 (6818): 363–6. PMID 11201747. doi:10.1038/35053110. 
  2. ^ 2.0 2.1 Macrae IJ, Zhou K, Li F, Repic A, Brooks AN, Cande WZ, Adams PD, Doudna JA. Structural basis for double-stranded RNA processing by Dicer. Science. Jan 2006, 311 (5758): 195–8. PMID 16410517. doi:10.1126/science.1121638. 
  3. ^ Entrez Gene: DICER1 Dicer1, Dcr-1 homolog (Drosophila). （原始内容存档于2019-09-24）. 
  4. ^ Matsuda S, Ichigotani Y, Okuda T, Irimura T, Nakatsugawa S, Hamaguchi M. Molecular cloning and characterization of a novel human gene (HERNA) which encodes a putative RNA-helicase. Biochimica et Biophysica Acta. Jan 2000, 1490 (1-2): 163–9. PMID 10786632. doi:10.1016/S0167-4781(99)00221-3. 
  5. ^ Hammond SM. Dicing and slicing: the core machinery of the RNA interference pathway. FEBS Letters. Oct 2005, 579 (26): 5822–9. PMID 16214139. doi:10.1016/j.febslet.2005.08.079. 
  6. ^ 6.0 6.1 Cenik ES, Fukunaga R, Lu G, Dutcher R, Wang Y, Tanaka Hall TM, Zamore PD. Phosphate and R2D2 restrict the substrate specificity of Dicer-2, an ATP-driven ribonuclease. Molecular Cell. Apr 2011, 42 (2): 172–84. PMC 3115569 可免费查阅. PMID 21419681. doi:10.1016/j.molcel.2011.03.002. 
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