EF手

EF手
File:PDB 1osa EBI.jpg 重組的第四雙小核草履蟲鈣調蛋白結構
標識符
符號	efhand
蛋白質家族數據庫（Pfam）	PF00036
蛋白質互聯數據庫（InterPro）	IPR002048
蛋白質站點（PROSITE）	PDOC00018
蛋白質結構分類數據庫2（SCOP2）	1osa / SCOPe / SUPFAM
膜中蛋白質方向（OPM）蛋白質	1djx
可用的蛋白質結構： 蛋白質家族數據庫（Pfam）   結構 / ECOD   蛋白質資料庫（PDB） 結構生物信息學研究合作實驗室PDB; PDB歐洲; PDB日本 蛋白質資料庫概述（PDBsum） 結構概述 蛋白質資料庫（PDB） 1s6jA:375-402 1s6iA:375-403 1m39A:141-169 2a4jA:141-169 1oqpA:138-166 2bbnA:121-148 2bkhB:121-148 1mxeA:121-148 4cln :121-148 2bbmA:121-148 1cdmA:121-146 1lin :121-148 2bkiB:121-148 1oojA:121-148 1osa :121-148 1clm :121-147 1n0yB:121-148 1exrA:121-148 1rfjA:121-149 1ggzA:121-148 1ak8 :48-75 1sw8A:48-76 1j7oA:48-76 1f70A:48-76 1r2uA:56-84 1r6pA:56-84 1j1eA:56-84

EF手（英語：EF hand）是一種在鈣結合蛋白中發現的螺旋-環-螺旋結構域或結構基序。

EF手包括一個螺旋-環-螺旋拓撲結構，就像人類的手上拇指和食指，而Ca²⁺離子與其配體就位於環內。這一結構最早在小清蛋白中發現，小清蛋白含有三個EF手結構，與鈣離子結合而造成的肌肉放鬆有關。

EF手包含兩個α螺旋，由一個短的（通常包括12個氨基酸）環狀區域連接，常用於結合鈣離子。EF手也出現在鈣調蛋白的所有結構域和肌肉蛋白質肌鈣蛋白C中。

分類

• 自從EF手結構模體在1973年被描繪以來，迄今為止該家族的蛋白質已擴展到至少66個亞家族。EF手結構基元可以分為Canonical EF-hands和Pseudo EF-hands 兩大類：

File:EFhandtree.jpg

EF手蛋白家族的系統發育樹

亞族

• EPS15 homology (EH) domain – IPR000261

例子

人類基因組中，包含有EF手的蛋白質有：

• ACTN1、ACTN2、ACTN3、ACTN4、APBA2BP; AYTL1; AYTL2
• C14orf143; CABP1; CABP2; CABP3; CABP4; CABP5; CABP7; CALB1; CALB2; CALM2; CALM3; CALML3; CALML4; CALML5; CALML6; CALN1; CALU; CAPN1; CAPN11; CAPN2; CAPN3; CAPN9; CAPNS1; CAPNS2; CAPS; CAPS2; CAPSL; CBARA1; CETN1; CETN2; CETN3; CHP; CHP2; CIB1; CIB2; CIB3; CIB4; CRNN
• DGKA; DGKB; DGKG; DST; DUOX1; DUOX2
• EFCAB1; EFCAB2; EFCAB4A; EFCAB4B; EFCAB6; EFCBP1; EFCBP2; EFHA1; EFHA2; EFHB; EFHC1; EFHD1; EFHD2; EPS15; EPS15L1
• FKBP10; FKBP14; FKBP7; FKBP9; FKBP9L; FREQ; FSTL1; FSTL5
• GCA; GPD2; GUCA1A; GUCA1B; GUCA1C
• hippocalcin; HPCAL1; HPCAL4; HZGJ
• IFPS; ITSN1; ITSN2; KCNIP1; KCNIP2; KCNIP3; KCNIP4; KIAA1799
• LCP1
• MACF1; MRLC2; MRLC3; MST133; MYL1; MYL2; MYL5; MYL6B; MYL7; MYL9; MYLC2PL; MYLPF
• NCALD; NIN; NKD1; NKD2; NLP; NOX5; NUCB1; NUCB2
• OCM
• PDCD6; PEF1; PKD2; PLCD1; PLCD4; PLCH1; PLCH2; PLS1; PLS3; PP1187; PPEF1; PPEF2; PPP3R1; PPP3R2; PRKCSH; PVALB
• RAB11FIP3; RASEF; RASGRP; RASGRP1; RASGRP2; RASGRP3; RCN1; RCN2; RCN3; RCV1; RCVRN; REPS1; RHBDL3; RHOT1; RHOT2; RPTN; RYR2; RYR3
• S100A1; S100A11; S100A12; S100A6; S100A8; S100A9; S100B; S100G; S100Z; SCAMC-2; SCGN; SCN5A; SDF4; SLC25A12; SLC25A13; SLC25A23; SLC25A24; SLC25A25; SPATA21; SPTA1; SPTAN1; SRI
• TBC1D9; TBC1D9B; TCHH; TESC; TNNC1; TNNC2
• USP32
• VSNL1
• ZZEF1

另見

• 錨定結構域，另一種由α-螺旋組成的鈣結合結構基序。

延伸閱讀

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• Zhou Y, Yang W, Kirberger M, Lee HW, Ayalasomayajula G, Yang JJ. Prediction of EF-hand calcium-binding proteins and analysis of bacterial EF-hand proteins. Proteins. November 2006, 65 (3): 643–55. PMID 16981205. doi:10.1002/prot.21139. 
• Zhou Y, Frey TK, Yang JJ. Viral calciomics: interplays between Ca2+ and virus. Cell Calcium. July 2009, 46 (1): 1–17. PMID 19535138. doi:10.1016/j.ceca.2009.05.005. 
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外部連結

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• Haiech J. EF-hand protein database (EF-handome). European Calcium Society and the Université Libre de Bruxelles. [2009-08-29]. （原始內容存檔於2009-08-09）. upon request to haiech@pharma.u-strasbg.fr 
• Yang J. Calciomics. Georgia State University. [2009-08-29]. （原始內容存檔於2009-10-12）. prediction server for EF-hand calcium binding proteins