Dicer

維基百科,自由的百科全書
跳至導覽 跳至搜尋

Module:Infobox_gene第53行Lua錯誤:attempt to index field 'wikibase' (a nil value)

Dicer蛋白在人體內由DICER1基因編碼,是一種在RNA干擾中扮演着重要角色的RNA酶,屬於III型RNA酶。在RNA誘導沉默複合體(RISC)的活化中,Dicer扮演着核心角色。在RNA干擾過程中,Dicer可以將shRNA(小髮卡RNA)切割、加工爲siRNA(小干擾RNA),將miRNA前體加工爲miRNA(微RNA)。

功能[編輯]

File:MiRNA-biogenesis.jpg
Dicer酶的作用是將shRNA剪切爲siRNA或將miRNA前體剪切爲miRNA

Dicer酶會將轉錄而成的、經Drosha酶初步處理的shRNA(小髮卡RNA)剪切爲siRNA,或將miRNA前體(pre-miRNA)剪切爲miRNA。隨後,siRNA或miRNA會活化RISC的組裝和功能的行使,使RNA干擾得以繼續進行[1]

結構[編輯]

File:2ffl-by-domain.png
腸賈第鞭毛蟲(Giardia intestinalis)體內的Dicer蛋白。III型RNA酶結構域以綠色標出,PAZ以黃色標出,平臺結構域以紅色標出,連接不同結構域的螺旋以藍色標出[2]

人DICER蛋白屬於III型RNA酶,具有解旋酶活性以及PAZ結構域(Piwi英語Piwi/Argonaute/Zwille)[3][4]。除了上述結構域外,DICER蛋白還有兩個RNaseIII結構域和兩個雙鏈RNA結合結構域(DUF283和dsRBD)[5]

目前的研究表明PAZ結構域可以和shRNA(小髮卡RNA)3'端兩個凸出的核苷酸結合,III型RNA酶結構域則會在dsRNA周圍形成一個假二聚體,啓動核酸鏈的剪切,使shRNA長度逐漸縮短。PAZ結構域和III型RNA酶結構域之間的距離由連接他們的螺旋結構決定,會影響到產生的miRNA/siRNA長度[2]。Dicer的dsRBD結構域會與shRNA結合,不過目前並未解析出具體的結合位點。推測認爲dsRBD區可能會與一些調節蛋白(比如人體內的TRBP,果蠅體內的R2D2、Loqs)結合形成複合體,調控RNA酶活性,進而調節終產物的產生[6]。有推測認爲解旋酶結構域會參與對長基質的處理[6]

參見[編輯]

參考[編輯]

  1. ^ Bernstein E, Caudy A, Hammond S, Hannon G. Role for a bidentate ribonuclease in the initiation step of RNA interference. Nature. 2001, 409 (6818): 363–6. PMID 11201747. doi:10.1038/35053110. 
  2. ^ 2.0 2.1 Macrae IJ, Zhou K, Li F, Repic A, Brooks AN, Cande WZ, Adams PD, Doudna JA. Structural basis for double-stranded RNA processing by Dicer. Science. Jan 2006, 311 (5758): 195–8. PMID 16410517. doi:10.1126/science.1121638. 
  3. ^ Entrez Gene: DICER1 Dicer1, Dcr-1 homolog (Drosophila). (原始內容存檔於2019-09-24). 
  4. ^ Matsuda S, Ichigotani Y, Okuda T, Irimura T, Nakatsugawa S, Hamaguchi M. Molecular cloning and characterization of a novel human gene (HERNA) which encodes a putative RNA-helicase. Biochimica et Biophysica Acta. Jan 2000, 1490 (1-2): 163–9. PMID 10786632. doi:10.1016/S0167-4781(99)00221-3. 
  5. ^ Hammond SM. Dicing and slicing: the core machinery of the RNA interference pathway. FEBS Letters. Oct 2005, 579 (26): 5822–9. PMID 16214139. doi:10.1016/j.febslet.2005.08.079. 
  6. ^ 6.0 6.1 Cenik ES, Fukunaga R, Lu G, Dutcher R, Wang Y, Tanaka Hall TM, Zamore PD. Phosphate and R2D2 restrict the substrate specificity of Dicer-2, an ATP-driven ribonuclease. Molecular Cell. Apr 2011, 42 (2): 172–84. PMC 3115569可免費查閱. PMID 21419681. doi:10.1016/j.molcel.2011.03.002.