组学
（重定向自組學）
组学（英语：omics）又称生物组学[1]，在生物学中，是从个体角度对各类研究对象（一般为生物分子）的集合，进行系统性研究的学问[2]。这些研究对象的集合称为“组”。
组学的研究范围包括：机体内一整套特定的分子结构和功能、生物过程，以及其相互关系等。目前有基因组学、蛋白质组学、代谢物组学、代谢物组学、脂质组学、糖组学等，而组学即这些学科的总称。
组学的宗旨是：对“转化为有机体的结构、功能和动力学的生物分子池（pools of biological molecules）”，进行集体表征和量化[3][4]。
在英语中，“组”以 -ome 作为后缀，而“组学”以 -omics 作为后缀。例如，基因组学（genomics）是系统性研究生物体基因组（genome）中各种基因（gene）以及它们之间的相互关系的学科。
功能基因组学（functional genomics）旨在鉴定给定生物体中尽可能多的基因的功能。它将不同的组学技术例如转录组学（transcriptomics）和蛋白质组学（proteomics）与饱和突变体集合相结合[5]。
由于细胞内各种生物分子在时间和空间上是存在相互联系的，单纯研究某一生物分子常无法全面解释所面临的研究问题。因此，现今已进入多组学（multi-omics）联用时代，也就是通过基因组、蛋白组、代谢组等多维手段，描述生物生理病理模型的整体架构，以提供解决问题的新思路。
组学研究的种类[编辑]
基因组学[编辑]
表观基因组学[编辑]
表观基因组是基因组的支撑结构，包括蛋白质和 RNA 结合物、替代 DNA 结构以及 DNA 上的化学修饰。
- 表观基因组学： 现代技术包括通过染色体构象捕获进行的染色体构象、各种染色质免疫沉淀-测序和其他与蛋白质组分离相结合的测序方法，以及发现胞嘧啶化学修饰的测序方法，如亚硫酸氢盐测序。
- 核组学（nucleomics）：研究构成“细胞核作为一个复杂、动态的生物系统，称为核组（nucleome）”的完整基因组成分集[6][7]。 4D Nucleome Consortium于2017年正式加入国际人类表观基因组联合会 （页面存档备份，存于互联网档案馆）（International Human Epigenome Consortium, 缩写：IHEC）。
蛋白质组学[编辑]
脂类组学[编辑]
脂类组是细胞脂类的完整补充，包括对由生物体或系统产生的一组特定脂质所做的修饰。
- 脂类组学：脂类通路和网络的大规模研究。 使用质谱技术。
糖组学[编辑]
转录组学[编辑]
代谢物组学[编辑]
营养、药理、毒理[编辑]
其他[编辑]
- 行为遗传学
- 连接组学：研究连接组，即大脑中所有神经连接的总和。
- 相互作用组学
- 神经分析基因组学
- 干细胞基因组学
- 细胞组学：使用生物成像方法和生物信息学进行定量细胞分析和研究。
- 微生物组学：研究生活在特定环境生态位中的微生物群落的基因组。
参考文献[编辑]
- ^ 中国大百科全书总编委会 (编). 生物组学需要付费订阅. 中国大百科全书. 第三版网络版. 北京: 中国大百科全书出版社.
- ^ 组学. 术语在线. 全国科学技术名词审定委员会. （简体中文）
- ^ 存档副本. [2023-01-31]. （原始内容存档于2023-05-21）.
- ^ Subedi, Prabal; Moertl, Simone; Azimzadeh, Omid. Omics in Radiation Biology: Surprised but Not Disappointed. Radiation. 2022, 2: 124–129. doi:10.3390/radiation2010009 可免费查阅.
- ^ Holtorf, Hauke; Guitton, Marie-Christine; Reski, Ralf. Plant functional genomics. Naturwissenschaften. 2002, 89 (6): 235–249. Bibcode:2002NW.....89..235H. PMID 12146788. S2CID 7768096. doi:10.1007/s00114-002-0321-3.
- ^ Tashiro, Satoshi; Lanctôt, Christian. The International Nucleome Consortium. Nucleus. 2015-03-04, 6 (2): 89–92. PMC 4615172 可免费查阅. PMID 25738524. doi:10.1080/19491034.2015.1022703.
- ^ Cremer, Thomas; Cremer, Marion; Hübner, Barbara; Strickfaden, Hilmar; Smeets, Daniel; Popken, Jens; Sterr, Michael; Markaki, Yolanda; Rippe, Karsten. The 4D nucleome: Evidence for a dynamic nuclear landscape based on co-aligned active and inactive nuclear compartments. FEBS Letters. 2015-10-07, 589 (20PartA): 2931–2943. ISSN 1873-3468. PMID 26028501. S2CID 10254118. doi:10.1016/j.febslet.2015.05.037 可免费查阅 （English）.
延伸阅读[编辑]
- Big biology: The 'omes puzzle （页面存档备份，存于互联网档案馆）：关于“组学”现象的讨论
