核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶

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Ribulose-bisphosphon ate carboxylase
File:Rubisco.png
圖示RuBisCo四級結構的空間填充模型,可以看到以二聚體存在的的主鏈(灰/白)和小的側鏈(藍/橙)。
標識符
酶學委員會編號(EC編號)4.1.1.39
CAS號9027-23-0
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1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(英語:Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase,通常簡寫為RuBisCO)是一種(EC 4.1.1.39),化學式為:C2390H3700O703N658S21Mg[1],它在光合作用卡爾文循環裏催化第一個主要的碳固定反應,將大氣中游離的二氧化碳轉化為生物體內儲能分子,比如蔗糖分子。1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶可以催化1,5-二磷酸核酮糖與二氧化碳的羧化反應或與氧氣的氧化反應。同時RuBisCO也能使RuBP進入光呼吸途徑。

1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶可能是地球上含量最多的蛋白質[2]。從化學角度來說,它催化核酮糖-1,5-二磷酸(也稱為 RuBP)的羧化[3][4][5]

替代的碳固定途徑[編輯]

RuBisCO 在生物學上很重要,因為它催化無機碳進入生物圈的主要化學反應。雖然許多自養的細菌和古菌通過還原性乙酰輔酶A途徑、3-Hydroxypropionate bicycle或還原型檸檬酸循環固定碳,但與 RuBisCO 催化的碳固定相比,這些途徑對全球碳固定的貢獻相對較小。與 RuBisCO 不同,磷酸烯醇丙酮酸羧化酶 (Phosphoenolpyruvate carboxylase) 只能暫時固定碳。RuBisCO 是葉子中最豐富的蛋白質,反映了其重要性,占C3植物可溶性葉蛋白的 50%(占葉總氮的 20-30%)和C4植物可溶性葉蛋白的 30%(占葉總氮的 5-9%)。[5]鑑於其在生物圈中的重要作用,作物中 RuBisCO 的基因工程持續受到關注。

RuBisCO large chain,
catalytic domain
標識符
符號RuBisCO_large
蛋白質家族數據庫(Pfam)PF00016
蛋白質互聯數據庫(InterPro)英語InterProIPR000685
蛋白質站點(PROSITE)英語PROSITEPDOC00142
蛋白質結構分類數據庫2(SCOP2)英語Structural Classification of Proteins3rub / SCOPe / SUPFAM
可用的蛋白質結構:
蛋白質家族數據庫(Pfam)  結構 / ECOD  
蛋白質資料庫(PDB)結構生物信息學研究合作實驗室PDB; PDB歐洲; PDB日本
蛋白質資料庫概述(PDBsum)英語PDBsum結構概述
蛋白質資料庫(PDB)1aa1​, 1aus​, 1bwv​, 1bxn​, 1ej7​, 1geh​, 1gk8​, 1ir1​, 1ir2​, 1iwa​, 1rba​, 1rbl​, 1rbo​, 1rco​, 1rcx​, 1rld​, 1rsc​, 1rus​, 1rxo​, 1svd​, 1tel​, 1upm​, 1upp​, 1uw9​, 1uwa​, 1uzd​, 1uzh​, 1wdd​, 1ykw​, 2cwx​, 2cxe​, 2d69​, 2qyg​, 2rus​, 2v63​, 2v67​, 2v68​, 2v69​, 2v6a​, 3rub​, 4rub​, 5rub​, 8ruc​, 9rub
RuBisCO, N-terminal domain
標識符
符號RuBisCO_large_N
蛋白質家族數據庫(Pfam)PF02788
蛋白質互聯數據庫(InterPro)英語InterProIPR017444
蛋白質結構分類數據庫2(SCOP2)英語Structural Classification of Proteins3rub / SCOPe / SUPFAM
可用的蛋白質結構:
蛋白質家族數據庫(Pfam)  結構 / ECOD  
蛋白質資料庫(PDB)結構生物信息學研究合作實驗室PDB; PDB歐洲; PDB日本
蛋白質資料庫概述(PDBsum)英語PDBsum結構概述
蛋白質資料庫(PDB)1aa1​, 1aus​, 1bwv​, 1bxn​, 1ej7​, 1geh​, 1gk8​, 1ir1​, 1ir2​, 1iwa​, 1rba​, 1rbl​, 1rbo​, 1rco​, 1rcx​, 1rld​, 1rsc​, 1rus​, 1rxo​, 1svd​, 1tel​, 1upm​, 1upp​, 1uw9​, 1uwa​, 1uzd​, 1uzh​, 1wdd​, 1ykw​, 2cwx​, 2cxe​, 2d69​, 2qyg​, 2rus​, 2v63​, 2v67​, 2v68​, 2v69​, 2v6a​, 3rub​, 4rub​, 5rub​, 8ruc​, 9rub
RuBisCO, small chain
標識符
符號RuBisCO_small
蛋白質家族數據庫(Pfam)PF00101
蛋白質互聯數據庫(InterPro)英語InterProIPR000894
蛋白質結構分類數據庫2(SCOP2)英語Structural Classification of Proteins3rub / SCOPe / SUPFAM
可用的蛋白質結構:
蛋白質家族數據庫(Pfam)  結構 / ECOD  
蛋白質資料庫(PDB)結構生物信息學研究合作實驗室PDB; PDB歐洲; PDB日本
蛋白質資料庫概述(PDBsum)英語PDBsum結構概述
蛋白質資料庫(PDB)1aa1​, 1aus​, 1bwv​, 1bxn​, 1ej7​, 1gk8​, 1ir1​, 1ir2​, 1iwa​, 1rbl​, 1rbo​, 1rco​, 1rcx​, 1rlc​, 1rld​, 1rsc​, 1rxo​, 1svd​, 1upm​, 1upp​, 1uw9​, 1uwa​, 1uzd​, 1uzh​, 1wdd​, 2v63​, 2v67​, 2v68​, 2v69​, 2v6a​, 3rub​, 4rub​, 8ruc

參見[編輯]

參考資料[編輯]

  1. ^ 核酮糖二磷酸羧化酶大链(EC 4.1.1.39)(RuBisCO 大亚基) 生物: Citrullus lanatus(西瓜)(Citrullus vulgaris)Expasy - ProtParam(注,计算结果包含部分修饰). web.expasy.org. [2026-02-28].  參數|title=值左起第38位存在換行符 (幫助)
  2. ^ 解開生命之謎:運用量子生物學,揭開生命起源與真相的前衛科學 p143
  3. ^ Cooper GM. 10.The Chloroplast Genome. The Cell: A Molecular Approach需要免費註冊 2nd. Washington, D.C.: ASM Press. 2000. ISBN 978-0-87893-106-4. , one of the subunits of ribulose bisphosphate carboxylase (rubisco) is encoded by chloroplast DNA. Rubisco is the critical enzyme that catalyzes the addition of CO2 to ribulose-1,5-bisphosphate during the Calvin cycle. It is also thought to be the single most abundant protein on Earth, so it is noteworthy that one of its subunits is encoded by the chloroplast genome. 
  4. ^ Dhingra A, Portis AR, Daniell H. Enhanced translation of a chloroplast-expressed RbcS gene restores small subunit levels and photosynthesis in nuclear RbcS antisense plants. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. April 2004, 101 (16): 6315–6320. Bibcode:2004PNAS..101.6315D. PMC 395966可免費查閱. PMID 15067115. doi:10.1073/pnas.0400981101可免費查閱. (Rubisco) is the most prevalent enzyme on this planet, accounting for 30–50% of total soluble protein in the chloroplast; 
  5. ^ 5.0 5.1 Feller U, Anders I, Mae T. Rubiscolytics: fate of Rubisco after its enzymatic function in a cell is terminated. Journal of Experimental Botany. 2008, 59 (7): 1615–1624. PMID 17975207. doi:10.1093/jxb/erm242可免費查閱.