KEGG

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京都基因與基因組百科全書
KEGG
內容
說明(描述)用於解密基因組的生物信息學資源
有機體(生物)全部
相關信息
研究中心京都大學
實驗室金久實驗室
主要參考文獻(引用)腳本錯誤:沒有「Catalog lookup link」這個模塊。
發布日期1995年
訪問
網站www.kegg.jp
網絡服務網址表現層狀態轉換參見KEGG應用程序接口
工具
網絡KEGG映射工具

京都基因與基因組百科全書Template:Langx縮寫KEGGTemplate:Langx)是一套日本於1995年制定的人類基因組計劃,此為關於基因基因組蛋白質酶促反應以及生物化學物質的網絡數據庫。其途徑數據庫腳本錯誤:沒有「Lang」這個模塊。之中記錄的是細胞之中的分子相互作用、代謝途徑以及具體生物所特有的變化形式。 但是它有一個缺點『無法由網頁介面作進一步的計算,例如建立複雜的調控網,或是找出反應之間可能的交互作用』。

介紹[編輯]

KEGG數據庫項目由京都大學化學研究所教授package.lua第80行Lua錯誤:module 'Module:Ilh/data' not found在1995年於日本人類基因組計劃首次提出。[1][2] 鑒於電算資源可用以輔助基因組序列數據的生物學詮釋,金久實開始研發KEGG PATHWAY數據庫。KEGG PATHWAY數據庫由一系列經人手繪製而成KEGG代謝路徑圖的構成,以代表關於代謝以及其他細胞生物機能的實驗成果。每一張路徑圖俱包括了一個分子互動與反應的網絡圖,為連繫基因組內之基因及路徑所示過程生成的基因產物(以蛋白質為主)而設。此數據庫衍生了KEGG路徑作圖的分析步驟,將基因組內的基因內容與KEGG PATHWAY數據庫比對,以調查可能在基因組中有相關紀錄的路徑及其相關功能。

開發者表示,KEGG是生物系統的「電腦表達形式」(computer representation)。[3]KEGG將生物系統的零件與線路綜合為一,具體而言,其所整合的是基因與蛋白質的遺傳部件、小分子及化學反應的化學部件、以及分子互動與反應網絡的線路圖。此概念於KEGG的數據庫之下,系統、基因組學、化學、健康資訊的分類下得以實現。[4]

參考資料[編輯]

  1. package.lua第80行Lua錯誤:module 'Module:Citation/CS1/People' not found
  2. package.lua第80行Lua錯誤:module 'Module:Citation/CS1/People' not found
  3. package.lua第80行Lua錯誤:module 'Module:Citation/CS1/People' not found
  4. package.lua第80行Lua錯誤:module 'Module:Citation/CS1/People' not found

外部鏈接[編輯]

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