KEGG
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| 內容 | |
|---|---|
| 說明(描述) | 用於解密基因組的生物信息學資源 |
| 有機體(生物) | 全部 |
| 相關信息 | |
| 研究中心 | 京都大學 |
| 實驗室 | 金久實驗室 |
| 主要參考文獻(引用) | 腳本錯誤:沒有「Catalog lookup link」這個模塊。 |
| 發布日期 | 1995年 |
| 訪問 | |
| 網站 | www |
| 網絡服務網址 | 表現層狀態轉換參見KEGG應用程序接口 |
| 工具 | |
| 網絡 | KEGG映射工具 |
京都基因與基因組百科全書(Template:Langx,縮寫:KEGG;Template:Langx)是一套日本於1995年制定的人類基因組計劃,此為關於基因、基因組、蛋白質、酶促反應以及生物化學物質的網絡數據庫。其途徑數據庫腳本錯誤:沒有「Lang」這個模塊。之中記錄的是細胞之中的分子相互作用、代謝途徑以及具體生物所特有的變化形式。 但是它有一個缺點『無法由網頁介面作進一步的計算,例如建立複雜的調控網,或是找出反應之間可能的交互作用』。
介紹[編輯]
KEGG數據庫項目由京都大學化學研究所教授package.lua第80行Lua錯誤:module 'Module:Ilh/data' not found在1995年於日本人類基因組計劃首次提出。[1][2] 鑒於電算資源可用以輔助基因組序列數據的生物學詮釋,金久實開始研發KEGG PATHWAY數據庫。KEGG PATHWAY數據庫由一系列經人手繪製而成KEGG代謝路徑圖的構成,以代表關於代謝以及其他細胞與生物機能的實驗成果。每一張路徑圖俱包括了一個分子互動與反應的網絡圖,為連繫基因組內之基因及路徑所示過程生成的基因產物(以蛋白質為主)而設。此數據庫衍生了KEGG路徑作圖的分析步驟,將基因組內的基因內容與KEGG PATHWAY數據庫比對,以調查可能在基因組中有相關紀錄的路徑及其相關功能。
開發者表示,KEGG是生物系統的「電腦表達形式」(computer representation)。[3]KEGG將生物系統的零件與線路綜合為一,具體而言,其所整合的是基因與蛋白質的遺傳部件、小分子及化學反應的化學部件、以及分子互動與反應網絡的線路圖。此概念於KEGG的數據庫之下,系統、基因組學、化學、健康資訊的分類下得以實現。[4]
- 系統信息
- PATHWAY — 細胞與生物機能的路徑圖
- MODULE — 基因模組與功能單位
- BRITE — 生物實體的階層分類
- 基因組信息
- 化學信息
- 健康信息
參考資料[編輯]
外部鏈接[編輯]
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