KEGG

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京都基因与基因组百科全书
KEGG
内容
说明(描述)用于解密基因组的生物信息学资源
有机体(生物)全部
相关信息
研究中心京都大学
实验室金久实验室
主要参考文献(引用)PMID 10592173
发布日期1995年
访问
网站www.kegg.jp
网络服务网址表现层状态转换参见KEGG应用程序接口
工具
网络KEGG映射工具

京都基因与基因组百科全书Template:Langx缩写KEGGTemplate:Langx)是一套日本于1995年制定的人类基因组计划,此为关于基因基因组蛋白质酶促反应以及生物化学物质的网络数据库。其途径数据库package.lua第80行Lua错误:module 'Module:Unicode data' not found之中记录的是细胞之中的分子相互作用、代谢途径以及具体生物所特有的变化形式。 但是它有一个缺点‘无法由网页界面作进一步的计算,例如建立复杂的调控网,或是找出反应之间可能的交互作用’。

介绍[编辑]

KEGG数据库项目由京都大学化学研究所教授package.lua第80行Lua错误:module 'Module:Ilh/data' not found在1995年于日本人类基因组计划首次提出。[1][2] 鉴于电算资源可用以辅助基因组序列数据的生物学诠释,金久实开始研发KEGG PATHWAY数据库。KEGG PATHWAY数据库由一系列经人手绘制而成KEGG代谢路径图的构成,以代表关于代谢以及其他细胞生物机能的实验成果。每一张路径图俱包括了一个分子互动与反应的网络图,为连系基因组内之基因及路径所示过程生成的基因产物(以蛋白质为主)而设。此数据库衍生了KEGG路径作图的分析步骤,将基因组内的基因内容与KEGG PATHWAY数据库比对,以调查可能在基因组中有相关纪录的路径及其相关功能。

开发者表示,KEGG是生物系统的“电脑表达形式”(computer representation)。[3]KEGG将生物系统的零件与线路综合为一,具体而言,其所整合的是基因与蛋白质的遗传部件、小分子及化学反应的化学部件、以及分子互动与反应网络的线路图。此概念于KEGG的数据库之下,系统、基因组学、化学、健康资讯的分类下得以实现。[4]

参考资料[编辑]

  1. package.lua第80行Lua错误:module 'Module:Citation/CS1/People' not found
  2. package.lua第80行Lua错误:module 'Module:Citation/CS1/People' not found
  3. package.lua第80行Lua错误:module 'Module:Citation/CS1/People' not found
  4. package.lua第80行Lua错误:module 'Module:Citation/CS1/People' not found

外部链接[编辑]

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