酶學委員會編號
酶學委員會編號或酶編號（英語：Enzyme Commission number），簡稱EC編號或EC號（EC number），是一種基於酶催化化學反應而制定數字分類方案。[1]作為酶命名法 / 酶學委員會命名法（enzyme nomenclature）系統，[2]同時會為各種酶給予一個建議的名稱，且每個EC編號都與相應酶催化反應的推薦名稱相關聯。
EC編號並非針對不同種類的酶，而是針對酶催化的反應。如果不同的酶（例如來自不同生物體的酶）催化相同的反應，則它們會獲得相同的EC編號。[3]此外，通過趨同進化，完全不同的蛋白質摺疊可以催化相同的反應（這些有時被稱為非同源同功能酶）[4]因此會被分配相同的EC編號。相比之下，聯合蛋白數據庫標識符通過氨基酸序列唯一地指定蛋白質。[5]
編號數字格式[編輯]
每個酶代碼均由字母「EC」和四個以句點分隔的數字組成（例如EC X.X.X.X）。這些數字代表酶的逐級精細分類。目前存在一些初步認定的EC編號，其第四位（序列號）數字包含「n」（例如 EC 3.5.1.n3）。[3]
例如，三肽氨基肽酶的編號為「EC 3.4.11.4」，其組成部分表示以下酶組：
- EC 3代指水解酶（利用水分解其他分子的酶）
- EC 3.4代指是作用於肽鍵的水解酶
- EC 3.4.11.4指從三肽氨基末端裂解的酶
頂層編號[編輯]
注意：酶分類編號與「格式編號」不同
| 組別 | 被催化的化學反應 | 典型反應 | 酶的例子（俗名） |
|---|---|---|---|
| EC 1 氧化還原酶 |
AH + B → A + BH (還原) A + O → AO (氧化) |
脫氫酶、氧化酶 | |
| EC 2 轉移酶 |
將官能基從一種物質轉移到另一種物質。該基團可以是甲基、酰基、氨基或磷酸基 | AB + C → A + BC | 轉氨酶、激酶 |
| EC 3 水解酶 |
通過水解基質並形成兩種產物 | AB + H2O（水分子） → AOH + BH | 脂肪酶、蛋白酶 / 肽酶、澱粉酶、磷酸酶 |
| EC 4 裂解酶 |
非水解性地從基質增加或去除某些基團。碳-碳鍵（C-C）、碳-氮鍵（C-N）、碳-氧鍵（C-O） 或碳-硫鍵（C-S）等共價鍵可能會斷裂 | RCOCOOH（羧基） → RCOH（醛基） + CO2（二氧化碳）或[X-A+B-Y] → [A=B + X-Y] | 羧基裂解酶 / 脫羧酶 |
| EC 5 異構酶 |
對分子內進行重新排列，即單個分子內的同分異構化 | ABC → BCA | 異構酶、變位酶 |
| EC 6 連接酶 |
通過合成新的碳-氧、碳-硫、碳-氮或碳-碳鍵並同時分解三磷酸腺苷，將兩個分子連接在一起 | X + Y + ATP（三磷酸腺苷） → XY + ADP（二磷酸腺苷） + Pi（磷酸） | 合成酶 |
| EC 7 易位酶 |
催化離子或分子跨膜運動或膜內分離 | 膜轉運蛋白, 鈉鉀泵 |
反應相似性[編輯]
可以通過使用化學鍵變化、反應中心或亞結構指標（以前稱為 EC-BLAST，現為EMBL-EBI酶門戶）來計算酶促反應之間的相似性。[7]
歷史[編輯]
在EC編號系統發展之前，酶的命名是任意的，通常使用諸如老黃酶（old yellow enzyme）和蘋果酸酶之類的名稱，這些名稱很少或根本沒有提供任何有關所催化反應的線索。大多數這些名稱已不再使用，但仍有少數名稱在使用，尤其是特異性很低的蛋白水解酶，例如胃蛋白酶和木瓜蛋白酶，因為根據特異性進行合理分類非常困難。
到了20世紀50年代，混亂已經讓人無法忍受，在霍夫曼-奧斯滕霍夫（Hoffman-Ostenhof）[8]、迪克森（Dixon）和韋伯（Webb）[9]提出了類似的酶催化反應分類方案，1955年在布魯塞爾舉行的國際生物化學大會成立了酶委員會，由馬爾科姆·迪克森擔任主席。第一版命名書籍發佈於1961年，酶委員會隨即解散，但其名稱以EC編號這一術語保留了下來。目前的第六版由國際生物化學和分子生物學聯合會於 1992年出版，是最後一個以印刷書籍形式出版的版本，包含3196種不同的酶。補編1—4出版於1993年至1999年。後續補編已以電子版形式發佈在國際生物化學與分子生物學聯盟（IUBMB）命名委員會的網站上。[6]2018年8月，IUBMB修改了該系統，添加了頂級EC 7（第七類）酶類別，即易位酶。[10][11]
參見[編輯]
參考文獻[編輯]
- ^ Webb, E. C. Enzyme nomenclature 1992: recommendations of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the nomenclature and classification of enzymes需要免費註冊. Academic Press. 1992. ISBN 978-0-12-227164-9.
- ^ 术语在线. [2025-07-16].
- ^ 3.0 3.1 ENZYME (Enzyme nomenclature database). ExPASy. [24 April 2019]. （原始內容存檔於21 March 2019）.
- ^ Omelchenko MV, Galperin MY, Wolf YI, Koonin EV. Non-homologous isofunctional enzymes: a systematic analysis of alternative solutions in enzyme evolution. Biology Direct. 2010, 5 (1): 第31頁. PMC 2876114 可免費查閱. PMID 20433725. doi:10.1186/1745-6150-5-31 可免費查閱.
- ^ Apweiler R, Bairoch A, Wu CH, Barker WC, Boeckmann B, Ferro S, Gasteiger E, Huang H, Lopez R, Magrane M, Martin MJ, Natale DA, O'Donovan C, Redaschi N, Yeh LS. UniProt: the Universal Protein knowledgebase. Nucleic Acids Research. Jan 2004, 32 (Database issue): D115–9. PMC 308865 可免費查閱. PMID 14681372. doi:10.1093/nar/gkh131.
- ^ 6.0 6.1 Moss GP. Recommendations of the Nomenclature Committee. International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the Nomenclature and Classification of Enzymes by the Reactions they Catalyse. [2006-03-14]. （原始內容存檔於2018-09-10）.
- ^ Rahman SA, Cuesta SM, Furnham N, Holliday GL, Thornton JM. EC-BLAST: a tool to automatically search and compare enzyme reactions. Nature Methods. Feb 2014, 11 (2): 171–174. PMC 4122987 可免費查閱. PMID 24412978. doi:10.1038/nmeth.2803.
- ^ Hoffman-Ostenhof, O. Suggestions for a more rational classification and nomenclature of enzymes. Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology 14. 1953: 219–260. ISBN 9780470122594. PMID 13057718. doi:10.1002/9780470122594.ch7.
- ^ Dixon, M; Webb, E.C. Enzymes. London: Longmans Green. 1958: 183–227.
- ^ Tipton, Keith. Enzyme Nomenclature News: Translocases (EC 7): A new EC Class. ExplorEnz: the primary source of the IUBMB enzyme list. August 2018 [3 November 2018]. （原始內容存檔於10 September 2018）.
- ^ 术语在线. [2025-07-16]. （原始內容存檔於2025-08-10）.
外部連結[編輯]
- 酶命名法，國際生物化學和分子生物學聯合會命名委員會的權威網站，由G.P.莫西（G.P.Moss）維護
- 酶命名數據庫 （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）—專家蛋白質分析系統（ExPASy）
- 所有EC編號列表—不倫瑞克酶學數據庫（BRENDA）
- 按EC編號瀏覽蛋白質數據庫（PDB）結構 （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- 按EC編號瀏覽SCOP域名 （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）—結構域中心基因本體數據庫（dcGO）
- 使用EC-Blast比較EC編號 互聯網檔案館的存檔，存檔日期2019-05-30.
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