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清理跨語言連結欧洲分子生物学实验室成為內部連結:編輯摘要的紅色連結經繁簡轉換後存在，非bot錯誤編輯 (本次機械人作業已完成17.3%)

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{{noteta
|G1 = Lifesciences
}}
{{infobox biodatabase
| title = 基因银行<br/>GenBank
| author =
| center = [[美国国家生物技术信息中心]]（NCBI）
| organism = 全部
| released = {{Start date and age|1982}}
| description = 超过300,000种生物体的核苷酸序列，并附有支持性书目和生物学注释。
| scope = {{ubl|核苷酸序列|蛋白质序列}}
| url = [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ NCBI]
| download = [https://ftp.ncbi.nih.gov/ ncbi ftp]
| webservice = {{ubl | [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25501/ eutils]| [https://web.archive.org/web/20110305021623/http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/soap/v2.0/eutils.wsdl soap]}}
| license = 不清楚<ref>[[加州大学圣克鲁斯分校|UCSC]]的[http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg38/bigZips/ 下载页面]显示“[[美国国家生物技术信息中心|NCBI]]对GenBank数据的使用或分发不做任何限制。但是，一些提交者可能对其提交的全部或部分数据主张{{le|生物专利|Biological patent|专利}}、版权或其他知识产权。NCBI无法评估此类主张的有效性，因此无法对GenBank中包含的信息的使用、复制或分发提供评论或无限制许可。”The at says "[[National Center for Biotechnology Information|NCBI]] places no restrictions on the use or distribution of the GenBank data. However, some submitters may claim Biological patent, copyright, or other intellectual property rights in all or a portion of the data they have submitted. NCBI is not in a position to assess the validity of such claims, and therefore cannot provide comment or unrestricted permission concerning the use, copying, or distribution of the information contained in GenBank."</ref>
| webapp = [[BLAST (生物技术)|BLAST]]
| standalone = BLAST
| format = {{Plainlist|
* [[XML]]
* [[ASN.1]]
* Genbank格式
}}
| pmid = 21071399
}}
'''基因银行'''（{{langx|en|GenBank}}，另译'''基因库'''、'''基因数据库'''）是一个[[开放获取]]的{{le|序列数据库|sequence database}}，对所有公开可利用的[[核苷酸序列]]与其翻译的[[蛋白质]]进行收集并注释。

此数据库是{{le|国际协作核酸序列数据库|International Nucleotide Sequence Database Collaboration|国际核酸序列数据库协作组织}}（INSDC）的一部分，由[[美国国家生物技术信息中心]]（NCBI）主管，NCBI为[[美国]][[国立卫生研究院 (美国)|国立卫生研究院]]的下属机构。GenBank和它的合作者从全球各个实验室接收了超过百万种生物的数据。

成立三十年来，GenBank数据库成为了最重要的也是最有影响力的生物全领域数据库，其数据正被全球数以百万计的研究人员获取与引用。GenBank中的数据量正以每18个月翻一番的速度持续[[指數增長]]<ref name="pmid18073190">{{cite journal | author=Benson D |display-authors=etal | title=GenBank | journal=Nucleic Acids Research | year=2008 | volume=36 | issue=Database | pages=D25–D30 | doi=10.1093/nar/gkm929 | pmid=18073190 | pmc=2238942 | last2=Karsch-Mizrachi | first2=I. | last3=Lipman | first3=D. J. | last4=Ostell | first4=J. | last5=Wheeler | first5=D. L. }}</ref><ref name="pmid18940867">{{cite journal | author=Benson D |display-authors=etal | title=GenBank | journal=Nucleic Acids Research | year=2009 | volume=37 | issue=Database | pages=D26–D31 | doi=10.1093/nar/gkn723 | pmid=18940867 | pmc=2686462 | last2=Karsch-Mizrachi | first2=I. | last3=Lipman | first3=D. J. | last4=Ostell | first4=J. | last5=Sayers | first5=E. W. }}</ref>，在2013年2月的版本194中，數據庫包含有1.62億個序列，含有1500億個核苷酸堿基。<ref name="ReleaseNotes">{{cite web |title=GenBank release notes |publisher=NCBI |url=ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genbank/gbrel.txt |accessdate=2013-12-02 |archive-date=2016-12-22 |archive-url=https://web.archive.org/web/20161222095339/https://ftp.ncbi.nih.gov/genbank/gbrel.txt |dead-url=no }}</ref>

== 历史 ==
1979年，[[洛斯阿拉莫斯国家实验室]]（LANL）[http://www.t10.lanl.gov/ 理论生物学和生物物理学小组] {{Wayback|url=http://www.t10.lanl.gov/ |date=20180704133625 }}的{{tsl|en|Walter Goad}}等人建立了洛斯阿拉莫斯序列数据库，最终成为了公共的 GenBank数据库的前身<ref name="lanl2000">{{cite web |last=Hanson |first=Todd |title=Walter Goad, GenBank founder, dies |work=Newsbulletin: obituary |publisher=Los Alamos National Laboratory |date=2000-11-21 |url=http://www.lanl.gov/orgs/pa/News/112100.html |accessdate=2013-12-02 |archive-date=2008-11-07 |archive-url=https://web.archive.org/web/20081107222611/http://www.lanl.gov/orgs/pa/News/112100.html |dead-url=no }}</ref>。1982年，由[[国立卫生研究院 (美国)|美国国立卫生研究院]]、美国国家科学基金会、美国能源部和国防部共同出资，LANL与[[BBN科技]]公司合作，成立了GenBank。到1983年底，已有超过2,000个序列被存储在GenBank。

在20世纪80年代中期，[[斯坦福大学]]的Intelligenetics bioinformatics公司与LANL合作经营着GenBank项目<ref name="lanl1994">{{Cite web |url=http://www.bio.net/bionet/mm/bionews/1994-January/000877.html |title=LANL GenBank History |accessdate=2013-12-02 |archive-date=2016-03-03 |archive-url=https://web.archive.org/web/20160303194610/http://www.bio.net/bionet/mm/bionews/1994-January/000877.html |dead-url=no }}</ref>。作为最早的互联网[[生物信息学]]社区项目，GenBank计划为生物学家打造一个[[开放获取]]的{{tsl|en|BIOSCI}}/Bionet消息社群。1989到1992年，GenBank被转移到新成立的[[美国国家生物技术信息中心]]<ref name="pmid2326192">{{cite journal | author=Benton D | title=Recent changes in the GenBank On-line Service | url=https://archive.org/details/sim_nucleic-acids-research_1990-03-25_18_6/page/1516 | journal=Nucleic Acids Research | year=1990 | volume=18 | issue=6 | pages= 1517–1520 | doi=10.1093/nar/18.6.1517 | pmid=2326192 | pmc=330520}}</ref>。

[[File:NucleotideSequences 86 87.jpeg|300px|thumb|Genbank和[[欧洲分子生物学实验室]]（EMBL）在1986/1987年出版的《核苷酸序列》第一至第七卷]]
[[File:Genbank100CD.jpg|300px|thumb|Genbank v100版本的CDRom]]

==发展==
[[Image:Growth of Genbank.svg|thumb|GenBank中碱基对数目的增长，1982年到2018年，[[半對數圖]]]]

在GenBank的版本162.0（2007年8月）的[[发行说明]]中道出：“从1982年到现在，GenBank中的碱基数每隔18个月翻一番。”<ref>{{cite journal|title=GenBank|pages=D36–42|issn=1362-4962|journal=Nucleic Acids Research|volume=41|issue=Database issue|date=2013-01|doi=10.1093/nar/gks1195|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23193287|accessdate=2019-02-12|author=Dennis A. Benson, Mark Cavanaugh, Karen Clark, Ilene Karsch-Mizrachi, David J. Lipman, James Ostell, Eric W. Sayers|pmid=23193287|pmc=3531190|archive-date=2020-05-14|archive-url=https://web.archive.org/web/20200514004720/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23193287|dead-url=no}}</ref>

{{As of|2013|07|08}}，GenBank的版本196.0已有165,740,164个[[基因座]]，152,599,230,112个碱基，165,740,164个报导序列<ref name="ReleaseNotes"/>。
GenBank数据库还包括一些额外的数据集，不包括在这个统计内。

{| class="wikitable"
|+GenBank中碱基数前二十的物种（版本 191）<ref name="pmid21071399">{{cite journal |author=Benson DA, Karsch-Mizrachi I, Lipman DJ, Ostell J, Sayers EW |title=GenBank |journal=Nucleic Acids Res. |volume=39 |issue=Database issue |pages=D32–37 |doi=10.1093/nar/gkq1079 |pmid=21071399 |pmc=3013681|date=January 2011}}</ref>
! [[物种]]
! [[碱基对]]
|-
|[[智人]] ''Homo sapiens''
|align="right"| {{nts|16,310,774,187}}
|-
|[[小家鼠]] ''Mus musculus''
|align="right"| {{nts|9,974,977,889}}
|-
|[[褐鼠]] ''Rattus norvegicus''
|align="right"| {{nts|6,521,253,272}}
|-
|[[家牛]] ''Bos taurus''
|align="right"| {{nts|5,386,258,455}}
|-
|[[玉米]] ''Zea mays''
|align="right"| {{nts|5,062,731,057}}
|-
|[[野豬]] ''Sus scrofa''
|align="right"| {{nts|4,887,861,860}}
|-
|[[斑馬魚]] ''Danio rerio''
|align="right"| {{nts|3,120,857,462}}
|-
|{{le|紫色球海胆|Strongylocentrotus purpuratus}} ''Strongylocentrotus purpuratus''
|align="right"| {{nts|1,435,236,534}}
|-
|[[普通獼猴]] ''Macaca mulatta''
|align="right"| {{nts|1,256,203,101}}
|-
|[[水稻]] ''Oryza sativa Japonica Group''
|align="right"| {{nts|1,255,686,573}}
|-
|[[烟草]] ''Nicotiana tabacum''
|align="right"| {{nts|1,197,357,811}}
|-
|[[非洲爪蟾]] ''Xenopus (Silurana) tropicalis''
|align="right"| {{nts|1,249,938,611}}
|-
|[[黑腹果蝇]] ''Drosophila melanogaster''
|align="right"| {{nts|1,119,965,220}}
|-
|[[黑猩猩]] ''Pan troglodytes''
|align="right"| {{nts|1,008,323,292}}
|-
|[[拟南芥]] ''Arabidopsis thaliana''
|align="right"| {{nts|1,144,226,616}}
|-
|[[家犬]] ''Canis lupus familiaris''
|align="right"| {{nts|951,238,343}}
|-
|[[酿酒葡萄]] ''Vitis vinifera''
|align="right"| {{nts|999,010,073}}
|-
|[[原雞]] ''Gallus gallus''
|align="right"| {{nts|899,631,338}}
|-
|[[大豆]] ''Glycine max''
|align="right"| {{nts|906,638,854}}
|-
|[[普通小麦]] ''Triticum aestivum''
|align="right"| {{nts|898,689,329}}
|}

==参阅==
* [[Ensembl]]
* {{le|人类蛋白质参考数据库|Human Protein Reference Database}}（HPRD）
* [[序列分析]]
* [[UniProt|通用蛋白质资源库]]（UniProt）
* [[已测序真核生物基因组列表]]
* [[已测序古菌基因组列表]]
* {{le|参考序列|RefSeq}} — 参考序列数据库
* [[Geneious]] — 包括GenBank提交工具
* {{le|开放科学数据|Open scientific data}}
*[[开放标准]]

== 参考文献 ==
{{reflist|30em}}

*{{NCBI-handbook}}

==外部链接==
*[https://web.archive.org/web/20091204062527/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=nucleotide GenBank]
*[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/28302128 血红蛋白β序列记录示例]
*[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/ BankIt]
*[https://web.archive.org/web/19970615053855/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/index.html Sequin] — 由NCBI开发的独立软件工具，用于向GenBank序列数据库提交和更新条目。
*[http://emboss.sourceforge.net EMBOSS] — 免费的开源分子生物学软件
*[https://web.archive.org/web/20070918023254/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=handbook.section.GenBank_ASM GenBank、RefSeq、TPA和UniProt：名称代表什么？]

{{Bioinformatics}}
{{normdaten}}

{{Authority control}}

[[Category:美国国立卫生研究院]]
[[Category:生物學資料庫]]
[[Category:遗传学数据库]]
[[Category:基因组数据库]]
[[Category:生物信息学]]

GenBank - 版本历史

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