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==荧光属性== ===发射与吸收波长=== 在[[螢光顯微鏡]]觀察下,與雙股DNA結合的DAPI染劑在358 nm([[紫外线]])处有一个最大吸收峰,并在461 nm(蓝)处有一个最大发射峰,其發射光的波長範圍含蓋了藍色至青綠色,因此在荧光显微技术中DAPI被[[紫外线]]照亮且被蓝或青色滤镜检出。DAPI也可以和[[RNA]]結合,但產生的螢光強度不及與DNA結合的結果,其發射光的波長範圍約在400 nm左右。<ref>Scott Prahl, [http://omlc.ogi.edu/spectra/PhotochemCAD/html/dapi(H2O).html DAPI] {{Wayback|url=http://omlc.ogi.edu/spectra/PhotochemCAD/html/dapi(H2O).html |date=20131029185614 }}. accessed 2009-12-08.</ref><ref>Kapuscinski J., [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1696951] {{Wayback|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1696951 |date=20180422202658 }}. accessed 2013-02-25.</ref><ref name="DAPI Nucleic Acid Stain">Invitrogen, [http://probes.invitrogen.com/media/pis/mp01306.pdf DAPI Nucleic Acid Stain] {{Wayback|url=http://probes.invitrogen.com/media/pis/mp01306.pdf |date=20090306113851 }}. accessed 2009-12-08.</ref> DAPI的發射光為藍色,且DAPI和[[荧光素]]、[[綠色螢光蛋白]](Green fluorescent protein, GFP)或Texas Red染劑(紅色螢光染劑)的發射波長,僅有少部分重疊,研究員可以善用這項特性在單一的樣品上進行多重螢光染色。如果需要十分精确的分析,可以使用光谱去混合(spectral unmixing)技術計算此一影响。 [[File:1D30 DNA DAPI.png|250px|thumb|DAPI 结合于DNA小沟(蓝和绿). From {{PDB|1D30}}.]] ===吸收模型=== 2013年,有研究者以{{tsl|en|Time-dependent density functional theory|含时密度泛函理论}}與[[等電位聚焦]]的{{link-en|连续极化介质模型|Polarizable continuum model}}描述了DAPI與DNA結合與發出螢光的機制,此一量子力学模型解释了DAPI與DNA結合後吸收與发射光譜的現象,與DNA的結合會使DAPI分子因位向限制導致幾何彈性降低,且周圍環境的[[極性]]甚低會導致DAPI分子的極性降低。<ref name="model">{{cite journal |author1=A. Biancardi |author2=T. Biver |author3=F. Secco |author4=B. Mennucci |title=An investigation of the photophysical properties of minor groove bound and intercalated DAPI through quantum-mechanical and spectroscopic tools. |doi=10.1039/C3CP44058C |journal=Phys. Chem. Chem. Phys. |year=2013 |volume=15 |page=4596|bibcode=2013PCCP...15.4596B }}</ref>
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