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== 分類 ==
{{See also|生物病毒分類表}}
由於病毒並不像其他生物能藉由交配產生後代，因此在種別的定義上與一般生物有所不同。

=== ICTV分类法 ===
[[國際病毒分類委員會]]（International Committee on Taxonomy of Viruses，簡稱ICTV）在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。其七届ICTV会议首次规范化了病毒物种的概念，即病毒分类的分支层次中的最低分类单元。<ref>Fields  p. 27
* As defined therein, "a virus species is a polythetic class of viruses that constitute a replicating lineage and occupy a particular ecological niche". A“polythetic" class is one whose members have several properties in common, although they do not necessarily all share a single common defining one. Members of a virus species are defined collectively by a consensus group of properties. Virus species thus differ from the higher viral taxa, which are“universal”classes and as such are defined by properties that are necessary for membership.（根据该定义，“病毒物种是构成一个复制谱系并占据特定生态位的多基因病毒类别”。“多基因”病毒类别是指其成员具有若干共同属性，尽管它们并不一定都具有一个共同的定义属性。病毒物种的成员由一组一致的属性共同定义。因此，病毒物种不同于更高级的病毒分类单元，后者是“通用”类别，因此由成员资格所必需的属性来定义。）</ref>分類的主要依據是病毒顆粒的特性、抗原特性與生物特性。ICTV是国际微生物学会联合会（International Union of microgical Societies）发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构。该系统与细胞生物分类系统有许多共同特征，如分类单元结构。但也存在某些差异，比如所有分类名称都使用斜体，这与国际藻类、真菌和植物命名法、国际原核生物命名法和国际动物命名法不同。到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究，从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的，而来自环境中（如海水、大洋沉积物等）的病毒样品则大部分的序列都是全新的。<ref>{{Cite journal |last=Delwart |first=Eric L. |title=Viral metagenomics |url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/rmv.532 |journal=Reviews in Medical Virology |language=en |date=2007 |volume=17 |issue=2 |doi=10.1002/rmv.532 |issn=1099-1654 |pmc=7169062 |pmid=17295196 |access-date=2025-02-06 |archive-date=2025-08-04 |archive-url=https://web.archive.org/web/20250804003319/https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/rmv.532 |dead-url=no }}</ref>

病毒分类从域开始，结构如下，分类后缀在括号中：<ref name=ictvcode >{{Cite web|url=https://talk.ictvonline.org/information/w/ictv-information/383/ictv-code|title=ICTV Code|last=|first=|date=|website=talk.ictvonline.org|publisher=International Committee on Taxonomy of Viruses|access-date=26 April 2020|quote=|archive-date=2018-07-12|archive-url=https://web.archive.org/web/20180712222159/https://talk.ictvonline.org/information/w/ictv-information/383/ictv-code|dead-url=yes}}</ref>
:[[域 (病毒学)|域]] Realm (''-viria'')
::亚域 Subrealm (''-vira'')
:::[[界 (生物)|界]] Kingdom (''-viriae'')
::::亚界 Subkingdom (''-virites'')
:::::[[门 (生物)|门]] Phylum (''-viricota'')
::::::亚门 Subphylum (''-viricotina'')
:::::::[[纲 (生物)|纲]] Class (''-viricetes'')
::::::::亚纲 Subclass (''-viricetidae'')
:::::::::[[目 (生物)|目]] Order (''-virales'')
::::::::::亚目 Suborder (''-virineae'')
:::::::::::[[科 (生物)|科]] Family (''-viridae'')
::::::::::::亚科 Subfamily (''-virinae'')
:::::::::::::[[属 (生物)|属]] Genus (''-virus'')
::::::::::::::亚属 Subgenus (''-virus'')
:::::::::::::::[[物种|种]] Species

物种名称通常以[疾病]病毒的形式出现，尤其是高等动植物。ICTV2024版分类表中总共有7个域、11个界、22个门、4个亚门、49个纲、93个目、12个亚目、368个科、213个亚科、3769个属、86个亚属与16215个种。<ref name = ictv_2024>{{cite web|url=https://ictv.global/taxonomy|title=Virus Taxonomy: 2024 Release|website=talk.ictvonline.org|publisher=International Committee on Taxonomy of Viruses|access-date=10 March 2025|archive-date=2020-03-20|archive-url=https://web.archive.org/web/20200320103754/https://talk.ictvonline.org/taxonomy|dead-url=no}}</ref>除亚域、亚界和亚纲外，其他级别的分类单元都被使用。共有1个地位未定纲、22个地位未定科及2个地位未定属被承认。

域: 
{{colbegin|colwidth=20em}}{{common taxon list|italic=yes
|A型DNA病毒域|Adnaviria|
|双链DNA病毒域|Duplodnaviria|
|单链DNA病毒域|Monodnaviria|
|核糖病毒域|Riboviria|
|核酶病毒域|Ribozyviria|
|单果冻病毒域|Singelaviria|
|多变DNA病毒域|Varidnaviria|
}}{{colend}}

地位未定纲: 
{{colbegin|colwidth=20em}}{{common taxon list|italic=yes
|纳尔达病毒纲|Naldaviricetes|
}}{{colend}}

地位未定科:
{{colbegin|colwidth=20em}}{{common taxon list|italic=yes
|阿尔法卫星病毒科|Alphasatellitidae|
|瓶状病毒科|Ampullaviridae|
|指环病毒科|Anelloviridae|
|鳄梨日斑类病毒科|Avsunviroidae|
|巴通体GTA组病毒科|Bartogtaviriformidae|
|双尾病毒科|Bicaudaviridae|
|短螺旋体GTA组病毒科|Brachygtaviriformidae|
|棒状病毒科|Clavaviridae|
|微小纺锤形噬菌体科|Fuselloviridae|
|球状病毒科|Globuloviridae|
|滴狀病毒科|Guttaviridae|
|嗜盐纺锤形噬菌体科|Halspiviridae|
|伊察姆纳病毒科|Itzamnaviridae|
|卵形病毒科|Ovaliviridae|
|芽生噬菌体科|Plasmaviridae|
|多去氧核糖核酸病毒科|Polydnaviridae|
|带球病毒科|Portogloboviridae|
|马铃薯纺锤形块茎类病毒科|Pospiviroidae|
|红细菌目GTA组病毒科|Rhodogtaviriformidae|
|嗜热圈形病毒科|Spiraviridae|
|奇古菌纺锤形噬菌体科|Thaspiviridae|
|番茄曲叶卫星病毒科|Tolecusatellitidae|
}}{{colend}}

地位未定属: 
{{colbegin|colwidth=20em}}{{common taxon list|italic=yes
|沟鞭藻病毒属|Dinodnavirus|
|壶菌病毒属|Rhizidiovirus|
}}{{colend}}

=== 基于结构的病毒分类 ===
有些研究认为，从不同生态环境感染宿主的某些病毒群（如细菌顶盖病毒和真核腺病毒、原核有尾噬菌体和真核疱疹病毒）观察到的病毒粒子组装和结构的相似性反映了这些病毒之间的进化关系。<ref>{{Cite journal | vauthors = Bamford DH | title = Do viruses form lineages across different domains of life? | journal = Research in Microbiology | volume = 154 | issue = 4 | pages = 231–6 | date = May 2003 | pmid = 12798226 | doi = 10.1016/S0923-2508(03)00065-2 }}</ref> 因此，病毒之间的结构关系被认为是定义更高分类级别（基于结构的病毒谱系）的基础，可以补充现有的ICTV分类方案。<ref>{{Cite journal | vauthors = Krupovič M, Bamford DH | title = Order to the viral universe | url = https://archive.org/details/sim_journal-of-virology_2010-12_84_24/page/12476 | journal = Journal of Virology | volume = 84 | issue = 24 | pages = 12476–9 | date = December 2010 | pmid = 20926569 | pmc = 3004316 | doi = 10.1128/JVI.01489-10 }}</ref>

=== 巴尔的摩分类法 ===
{{Main|巴爾的摩病毒分類系統}}
[[File:Virus Baltimore Classification.svg|300px|thumb|巴尔的摩分类法是基于病毒mRNA的合成方式]]
诺贝尔奖获得者生物学家[[戴维·巴尔的摩]]在1970年代提出了巴尔的摩分类系统。<ref name="pmid4348509"/><ref name="pmid4377923">{{Cite journal |last=Baltimore |first=D. |title=The strategy of RNA viruses |url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/4377923/ |journal=Harvey Lectures |date=1974–1975 |volume=70 Series |issn=0073-0874 |pmid=4377923 |access-date=2025-02-06 |archive-date=2025-04-22 |archive-url=https://web.archive.org/web/20250422142105/https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/4377923/ |dead-url=no }}</ref>巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类。<ref name="pmid15078590">{{Cite journal |last=van Regenmortel |first=Marc H.V. |last2=Mahy |first2=Brian W.J. |title=Emerging Issues in Virus Taxonomy |url=http://wwwnc.cdc.gov/eid/article/10/1/03-0279_article.htm |journal=Emerging Infectious Diseases |date=2004-01 |volume=10 |issue=1 |doi=10.3201/eid1001.030279 |issn=1080-6040 |pmc=3322749 |pmid=15078590 |access-date=2025-02-06 |archive-date=2012-10-25 |archive-url=https://web.archive.org/web/20121025063409/http://wwwnc.cdc.gov/eid/article/10/1/03-0279_article.htm |dead-url=no }}</ref><ref name="pmid10486120">{{Cite journal |last=Mayo |first=M.A. |title=Developments in plant virus taxonomy since the publication of the 6th ICTV Report |url=http://link.springer.com/10.1007/s007050050620 |journal=Archives of Virology |language=en |date=1999-08 |volume=144 |issue=8 |doi=10.1007/s007050050620 |issn=0304-8608}}</ref><ref name="pmid15183049">{{Cite journal |last=de Villiers |first=Ethel-Michele |last2=Fauquet |first2=Claude |last3=Broker |first3=Thomas R |last4=Bernard |first4=Hans-Ulrich |last5=zur Hausen |first5=Harald |title=Classification of papillomaviruses |url=https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S004268220400220X |journal=Virology |date=2004-06-20 |volume=324 |issue=1 |doi=10.1016/j.virol.2004.03.033 |issn=0042-6822 |access-date=2025-02-06 |archive-date=2025-07-10 |archive-url=https://web.archive.org/web/20250710211946/https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S004268220400220X |dead-url=no }}</ref>

巴尔的摩分类法是基于病毒[[mRNA]]的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中，必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制，但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是單股或雙股的RNA或DNA，可以有也可以没有[[反转录酶]]。而且，單股RNA病毒可以是[[義 (分子生物學)|正义]]（+）或反义（-）。这一分类法将病毒分为7类：

* 第一类是[[雙鏈DNA病毒|雙股DNA病毒]]（如[[腺病毒]]、[[疱疹病毒科|疱疹病毒]]、[[痘病毒科|痘病毒]]）
* 第二类是[[單鏈DNA病毒|單股DNA病毒]]（+）DNA（如[[小DNA病毒科|小DNA病毒]]）
* 第三类是[[雙鏈RNA病毒|雙股RNA病毒]]（如[[呼腸孤病毒科|呼腸孤病毒]]）
* 第四类是[[核糖核酸病毒|（+）單股RNA病毒]]（如[[微小核糖核酸病毒科|微小核糖核酸病毒]]、[[披盖病毒科|披盖病毒]]）
* 第五类是[[核糖核酸病毒|（-）單股RNA病毒]]（如[[正黏液病毒科|正黏液病毒]]、[[炮彈病毒科|炮彈病毒]]）
* 第六类是[[逆轉錄病毒|單股RNA反转录病毒]]（如[[逆转录病毒|反转录病毒]]）
* 第七类是[[DNA逆轉錄病毒|雙股DNA反转录病毒]]（如[[肝病毒科|肝病毒]]）
举一个病毒分类的例子：[[水痘]]病毒，即[[带状疱疹病毒]]，属于[[疱疹病毒目]]，[[疱疹病毒科]]，[[甲型疱疹病毒亞科|甲型疱疹病毒亚科]]，[[水稻病毒屬|水疱病毒属]]；同时，带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类，因为它是雙股DNA病毒，且不含有反转录酶。